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Nature:数百种人类肠道噬菌体的发现为研究肠道微生物组提供了新的途径

2025-05-01 16:06:26 100医药网

来源:100医药网 2025-11-03 09:39

这项工作为合成生物学、生物技术和微生物组疗法的未来应用奠定了基础;这是在解码人类肠道"病毒暗物质"道路上迈出的重要一步。

在一项由莫纳什大学生物科学学院的Jeremy J. Barr教授和哈德森医学研究所的Sam Forster副教授领导的国际研究中,科学家们在人类肠道细菌内发现了数百种新型病毒。这些被称为噬菌体的病毒,未来或可用于重塑肠道微生物组,进而可能影响肠道健康及多种疾病的发展进程。

这项发表在《自然》杂志上的研究是同类研究中的首例,它采用大规模、基于培养的方法来分离和研究人类肠道中的温和噬菌体。

研究团队使用了来自澳大利亚微生物组培养库的人类微生物组中的252株细菌分离物进行研究。这些分离物必须在实验室中使用特殊的无氧厌氧培养箱进行培养,然后用十种不同的化合物、食物和条件进行处理。令人惊讶的是,研究团队发现,常见的植物性代糖甜菊糖以及我们自身肠道细胞释放的化合物,是肠道噬菌体的主要激活剂。

该研究的资深作者Barr教授表示:"这是一项基础性研究,它改变了我们思考和研究人类肠道内病毒的方式。我们发现,人类肠道细胞产生的化合物可以唤醒肠道细菌内的休眠病毒。这可能对炎症性肠病等肠道疾病产生重大影响,因为这类疾病常伴有炎症和细胞死亡。"

研究还揭示,大多数肠道噬菌体处于休眠状态,仅有小部分能在测试条件下被激活。然而,当暴露于人类肠道细胞时,这些病毒的激活率显著跃升,这表明人类生物学在塑造肠道病毒景观方面扮演着重要且直接的角色。

该研究的第一作者Sofia Dahlman博士解释道:"我们早已知道肠道内充满了病毒,但直到现在,我们仍缺乏在实验室中研究它们的工具和实验方法。我们的研究结果表明,人类宿主并非被动环境,它正在积极地影响病毒的行为。"

利用基于CRISPR的基因工程技术,研究团队进一步识别出了能阻止病毒激活的病毒基因突变,这为了解某些肠道病毒如何进入永久休眠状态提供了见解。这一发现可能为未来旨在调控肠道微生物组以促进健康的治疗策略提供信息。这项研究代表了莫纳什大学与哈德森医学研究所以及其他几个国内外研究团队超过八年的合作成果。

Forster副教授相信,这项基础性研究将对健康转化产生重要影响。他说:"能够培养这些病毒使我们能够理解它们的功能,并为开发从炎症性肠病到癌症等疾病的微生物组疗法提供了机会。这项技术还提供了设计具有定制病毒功能的益生菌菌株的能力。"

Barr教授对此表示同意,他说:"这项工作为合成生物学、生物技术和微生物组疗法的未来应用奠定了基础;这是在解码人类肠道 病毒暗物质 道路上迈出的重要一步。"(100yiyao.com)

参考文献:

Sofia Dahlman et al, , Nature (2025). DOI: 10.1038/s41586-025-09614-7.

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