Journal of Genetics and Genomics：单细胞分辩率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱

水稻作为紧张的食粮作物，为环球一半以上的生齿提供主粮；同时，水稻作为票据叶形式动物，其个别发育与细胞分解遭到了科研职员继续和普遍的存眷。细胞功效的分解经常可以体现为基因表白的差别。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探求细胞的功效分解成为能够。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为票据叶动物的研讨任务提供症结的根底资本，为懂得动物发育的转录调控纪律提供新的认知。

中国迷信院与发育生物学研讨所研讨员钱文峰研讨组利用单细胞转录组测序技术，得到了水稻幼苗叶和根超过二十万个单细胞的转录组信息，应用已报道的细胞类型标志基因和原位杂交技术，对每个细胞的身份进行鉴定，构建了水稻幼苗叶和根的单细胞转录图谱。基于该图谱进一步发现，虽然叶和根的同品种型组织（例如，叶和根各自的维管组织，叶肉细胞和根皮层细胞）具备显着的转录组类似性，叶和根表皮组织的转录组却具备较年夜差别，这能够与地上部和公开部表皮组织所处外界情况的差别无关。

该研讨还比拟了多个成长前提上水稻幼苗单细胞转录图谱的差别，发现水稻在应答低氮、缺铁以及高盐钳制时，分歧类型的细胞经常采用细胞类型特异的转录相应，而同品种型细胞在相应分歧钳制时往往倾向于使用类似的转录调控机制。研讨职员还存眷到在钳制前提下幼苗表示出叶片发黄的征象。通过研讨细胞群体构成，作者发现钳制前提下叶肉细胞比例显着下降。通过进一步重构叶肉细胞的发育轨迹，发当初叶肉细胞发育的分歧阶段，分歧功效的基因依照特准时序依次动静相应，为懂得非生物钳制下细胞分解的差别提供了线索。该研讨为水稻全苗展开单细胞分辩率的组学研讨奠基了根底，为深化解析动物的性命运动提供了新的角度。(100yiyao.com）