玉米紧张自交系A188基因组研讨取得停顿

近日，中国农业迷信院作物迷信研讨所作物基因组选择育种立异团队与美国堪萨斯州立年夜学单干，对玉米紧张自交系A188的基因组进行了组装。该研讨在高质量的基因组组装根底上， 深化解析了玉米愈伤组织的基因表白和DNA甲基化特征，并应用比拟基因组办法提醒了基因组构造变异对玉米性状的紧张影响。相关研讨结果在线颁发在《基因组生物学（Genome Biology）》上。

据郑军研讨员引见，玉米自交系A188具备很强的胚性愈伤组织再生才能，常作为低劣的转基因受体利用于玉米遗传转化系统中，但其愈伤造成机理尚不分明，节制愈伤造成的紧张基因未被克隆。组装高质量A188基因组，将有助于解析玉米愈伤产生机理并克隆愈伤造成基因，进一步提升玉米转化效率。

本研讨对A188玉米自交系进行测序组装，并通过两个自力的小引列全基因组测序数据阐发，极年夜地削减了非核DNA在核染色体基因组中的净化，构建了高质量的A188基因组。通过比拟A188与玉米自交系B73参考基因组间的构造变异，发现了多个年夜片断的拷贝数变动和倒序，此中，ccd1基因拷贝数变异惹起的基因表白差别和y1基因的表白差别决议了A188与B73种子色彩和胡萝卜素含量的差异。研讨职员通过对A188自交系愈伤组织和幼苗组织的比拟阐发，发现了愈伤组织的DNA甲基化程度处于绝对高程度；通过对11种组织样品的阐发发现愈伤组织特异表白的基因包含多个进攻基因。这些成果提示愈伤组织细胞通过维持较高程度的DNA甲基化和提升进攻程度来减缓组织培育给愈伤组织细胞和其基因组所带来的钳制压力。此外，A188与自交系B73以及其他玉米主干自交系相比，A188在多种农艺性状方面均存在显着差别，A188基因组的组装也将推进其利用于其他农艺性状的研讨。(100yiyao.com）