Cell：单碱基分辨率下，DNA的折叠法则被彻底改写——基因调控的终极奥秘藏在何处？

在我们每个细胞核内仅几微米的空间里，盘绕着长达两米的DNA分子。如果将细胞核比作一个足球场，那么DNA就如同一团被揉乱的、长达数十公里的细线。然而，这团看似混乱的细线却以一种超乎想象的秩序在运作。在这片微观宇宙中，基因的表达被地调控着，决定了细胞的身份、功能乃至整个生命体的命运。一个核心的谜题在于：基因组中的 增强子 (enhancer)如何在浩瀚的DNA序列中，精准地找到并激活它们数万甚至数百万个碱基对之外的目标 启动子 (promoter)？

长久以来，我们对这种 远距离恋爱 的机制充满了想象。经典的染色质构象捕捉技术 (Chromosome Conformation Capture, 3C)，如Hi-C，为我们揭示了染色质在三维空间中的宏观折叠模式，比如拓扑关联结构域 (Topologically Associating Domains, TADs)。但这就像我们拥有了一张城市的卫星地图，能看到城区的划分，却无法看清街道上的人群是如何互动交流的。传统的观测精度停留在数百甚至数千个碱基对的尺度，而真正执行调控功能的蛋白质，转录因子 (transcription factor)和核小体 (nucleosome)，它们的 舞台 却只有几十到上百个碱基对大小。这种分辨率的鸿沟，让我们始终无法真正看清基因调控这部大戏最精彩的细节。

11月5日，《Cell》的研究报道 Mapping chromatin structure at base-pair resolution unveils a unified model of cis-regulatory element interactions ，为我们提供了一副前所未有的 超高倍显微镜 ，让我们得以在单个碱基对的水平上，凝视染色质的精细结构。这项工作不仅揭示了令人惊叹的微观世界，更提出了一个统一的模型，巧妙地融合了生物学、物理学和计算模拟，为我们理解基因调控的本质提供了一个全新的视角。