来源:BioArt 2025-12-08 16:34
本研究揭示了大肠杆菌HECT样E3泛素连接酶NleL在感染过程中发挥了双重作用。在人类和小鼠中,caspase-4及其同源物caspase-11是抵御革兰氏阴性菌感染的关键先天免疫因子。它们能在细胞质中直接感知细菌脂多糖(LPS),被激活后切割孔形成蛋白gasdermin D(GSDMD),促使其N端片段在质膜上组装成通道,最终引发一种以细胞溶解为特征的炎性细胞死亡 细胞焦亡(pyroptosis)【1, 2】。
通过这种方式,宿主可迅速清除受感染细胞,剥夺病原体的复制生态位并限制其扩散。
除LPS外,其他细菌组分如毒素或DNA可被炎症小体复合物识别。炎症小体的组装招募并激活caspase-1,使其切割GSDMD并释放IL-1 与IL-18,从而放大局部炎症反应【3】。这些机制构成了上皮防御的 自毁屏障 ,既能终止感染,也能警示邻近细胞。
面对如此严密的宿主防线,许多病原体演化出复杂的免疫逃逸策略。志贺菌的E3连接酶IpaH7.8可降解GSDMD与GSDMB,从而阻断焦亡;其效应子OspC3则直接抑制caspase-4/11的活化【4】。类似机制也存在于鼠疫耶尔森菌的YopM与致病性大肠杆菌的NleA,它们通过干扰caspase-1抑制炎症小体激活;NleF更能同时抑制caspase-4、-8和-9,协同封锁焦亡与凋亡【5, 6】。
通过这些策略,病原体在宿主体内短暂建立 免疫豁免区 ,为感染扩散赢得时间。
然而,在肠道上皮这种高更新组织中,受感染细胞除了经历凋亡、焦亡或坏死性凋亡外,还可被邻近健康细胞主动 挤出 (extrusion)到管腔,从而为宿主提供额外一道物理防线【7】。尽管多种病原体被证明能抑制细胞死亡,但针对这一 挤出 过程所依赖的细胞骨架重塑机制,目前仍未发现能够干扰该过程的毒力因子。
近日,Genentech公司Vishva M. Dixit与Giovanni Luchetti团队,联合俄勒冈健康与科学大学Isabella Rauch实验室等在Nature杂志发表了题为Enteropathogenic bacteria evade ROCK-driven epithelial cell extrusion的研究文章。
揭示了肠致病性大肠杆菌利用一类HECT样E3连接酶NleL,精准削弱宿主两道关键防线:一是靶向带有LPS感知CARD结构域的caspase-4/5/11并促其蛋白酶体降解,阻断非经典炎症小体介导的焦亡;二是靶向ROCK1/2(依赖ROCK2的PH结构域),抑制肌球蛋白轻链磷酸化与细胞骨架重塑,从而阻断受感染上皮细胞的 挤出 。 nleL突变株诱发更强的细胞挤出并降低结肠定植,而在Rock1/2缺失的上皮中该差异消失,证明ROCK是NleL的关键靶点。

为确定其他毒力因子是否靶向宿主焦亡信号,作者在人类类内皮EA.hy926细胞中筛选了63种大肠杆菌效应子,评估其阻断LPS诱导焦亡的能力。
作者发现仅NleL与NleF能显著抑制LPS诱导的细胞焦亡,表现为存活率上升和LDH释放下降。野生型NleL具备完整的HECT样E3连接酶活性,催化位点突变则无法抑制LPS诱导的细胞死亡,表明NleL的泛素连接酶活性对其抑制LPS诱导的细胞焦亡必不可少。此外,NleL并不影响caspase-1/GSDMD途径焦亡,提示NleL作用于非经典炎症小体上游。
通过定量质谱鉴定NleL底物,作者发现NleL特异靶向caspase-4与ROCK2。
NleL的催化活性可促使caspase-4(Lys87与Lys293)及ROCK2发生K48连接泛素化并被蛋白酶体降解,ROCK1丰度也同步下降;而其他caspase及已知底物如JNKs、IKKs均未受影响。免疫沉淀实验证实NleL直接结合并修饰caspase-4和ROCK1/2,且作用被蛋白酶体抑制剂阻断。
接下来作者通过结构-功能分析进一步解析了底物识别机制,发现NleL通过识别caspase-4/5/11的LPS感知CARD结构域完成泛素化。
CARD结构域互换实验表明,caspase-4的CARD可使caspase-1获得对NleL的敏感性,而caspase-1的CARD则赋予耐受性。AlphaFold建模显示,caspase-4的CARD缺乏死亡折叠蛋白典型的六股反平行 螺旋束结构,这一差异或解释其被NleL特异识别的分子基础。
ROCK1和ROCK2不含CARD结构域,截短和片段删除实验表明NleL主要识别ROCK2的C端PH结构域,该区域对NleL泛素化至关重要。纯化的PH结构域在体外即可被NleL修饰,而激酶结构域无效。进一步的互作分析显示,NleL的PPR结构域(Glu372 Gly486)介导与caspase-4结合,NEL结构域则结合ROCK1。
在功能层面,NleL通过降解caspase-4和ROCK1/2,协同抑制焦亡与上皮细胞挤出。感染实验表明, nleL菌株在Caco-2或肠上皮类器官单层中更加强烈地诱导ROCK底物MLC2磷酸化及肠上皮细胞的挤出。
活体成像显示,ROCK1/2可促进焦亡细胞被推出上皮层。体内实验中, nleL的Citrobacter rodentium菌在小鼠结肠的定植显著下降,脾脏扩散受限;而在Rock1/2缺失的IEC小鼠中,野生型与 nleL菌株的定植无差异。与此同时,ROCK缺失并未破坏上皮屏障完整性,证实ROCK1/2是NleL促进感染的直接靶点。
综上所述,本研究揭示了大肠杆菌HECT样E3泛素连接酶NleL在感染过程中发挥了双重作用:其一,通过靶向caspase-4/5/11削弱LPS感知与焦亡反应;其二,通过降解ROCK1/2关闭垂死细胞的挤出通道。两条通路的共同抑制,使细菌得以逃脱上皮的 驱逐机制 ,在肠道中建立稳定定植。
未来若能解析NleL与其底物的复合物结构,将揭示其识别与催化的分子逻辑,并为靶向效应子-宿主互作的抗感染策略提供新思路。
原文链接:
https://doi.org/10.1038/s41586-025-09645-0