Science Advances：提醒病毒

华中农业年夜学农业微生物学国度重点试验室曹罡课题组与李国亮课题组改革4C染色质构象捕捉技术， 捕捉了α-疱疹病毒和宿主的“跨界”染色质互作，为病毒和宿主基因组之间的染色质互相作用及病毒基因转录调控提供了新的见解。相关研讨以“RUNX1-mediated alphaherpesvirus-host trans-species chromatin interaction promotes viral transcription”为题颁发于Science Advances学术期刊。

哺乳植物的染色体盘踞细胞核的分歧区域，染色体内及染色体间产生着动静、精准的染色质互作，以完成基因表白的精准空间和光阴调控。疱疹病毒是一个年夜型基因组DNA病毒家族，可能感化包含人类在内的多种脊椎植物宿主。年夜多半真核DNA病毒，例如疱疹病毒，可以将它们的基因组运输到细胞核中。然而病毒基因组入核后若何精准定位，找到最适宜的地位，是否能与宿主基因组特同性互作，进而挟制宿主转录工场，迅速实现本人的转录与复制，仍旧知之甚少。染色体构象捕捉技术可以提醒细胞核中分歧染色体位点之间的近程染色质互相作用，有能够为病毒DNA与宿主染色质互作提供参考。

该团队使用伪狂犬病病毒 (PRV) 作为模子病毒，进行了染色体构象捕捉阐发，证实病毒与宿主之间特同性跨物种全基因组染色质互相作用。成果显示，PRV 基因组由宿主DNA联合卵白RUNX1介导、与宿主染色质开放区和转录沉闷区有交互。这有助于病毒挟制宿主II型RNA聚合酶（RNAPII），进行病毒基因的无效转录。如许的病毒基因转录，会被 RUNX1 克制剂或通过RNA烦扰显着克制。这一发现为病毒和宿主基因组之间的染色质互相作用提供了新的见解，并确定了新的研讨畛域，以匆匆进对疱疹病毒基因组转录的懂得。

研讨团队在PRV感化的PK15细胞中进行了多重环状染色体构象捕捉 (multiple 4C-seq) 阐发。起首进行甲醛交联以固定原位染色质复合物构造，然后染色质复合物颠末 Bam Hi消化、附近连贯、Alu I消化和自连贯。研讨职员设计了32对引物，相关位点别离在PRV基因组Bam Hi和 Alu I酶切位点两侧，并别离用于上述染色质片断的PCR扩增，扩减产物混合在一路用于4C文库构建。通过这种办法，未来自PRV和宿主细胞基因组的信息耦合成DNA嵌合片断，用于解析PRV基因组和宿主细胞之间的染色质互相作用。

本研讨提出了一种模子，PRV应用宿主DNA联合卵白RUNX1将其基因组介导到开放染色质和活性转录区，匆匆进病毒挟制宿主转录机制（如RNAPII），终极实时无效地转录病毒基因（图 1)。研讨发现，RUNX1克制剂Ro 5-3335克制了宿主细胞中PRV的增殖，这能够是伪狂犬病毒和其他疱疹病毒诱导疾病的潜在候选药物。这一发现为病毒和宿主基因组之间的互作提供了新的见解，并说明了病毒基因优先转录的分子机制，为开拓新的研讨畛域提供支持，以匆匆进咱们对疱疹病毒基因表白的懂得，进一步解析宿主细胞中具体的寄生病毒的性命周期。(100yiyao.com）